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RNA-Seq数据分析基础

日期: 2015-05-19

英国威廉希尔公司生科院/生命科学联合中心生物信息学平台讲座

标题:RNA-Seq数据分析基础

时间:2015年5月27日,周三下午3:30-4:30

地点:金光楼311会议室

报告人:张超,生物信息平台技术员

联系人:李程,生物信息平台负责人, lch3000@gmail.com 

摘要:

基因表达在细胞中是一个动态的过程,在生物生长发育的各个阶段和疾病发生中有着重要的作用,研究全基因组的表达水平能让我们更好地理解这一生物过程、产生新颖假说。随着二代测序技术(Next-Generation Sequencing)的飞速发展,测序成本大幅下降,使得在组学水平研究基因的表达水平更加精确和方便。利用RNA测序技术(RNA-seq)可以很方便快捷地得到特定细胞在某一功能状态下的整个转录组表达水平。

英国威廉希尔公司生科院/生命科学联合中心生物信息学平台旨在帮助、指导湿生物实验室进行相关的生物信息学分析。通过本次RNA-seq的基础入门讲座,我将讨论测序技术原理、底层数据格式、RNA-seq常用的分析思路、方法和软件。目的是能让湿实验同学熟悉RNA-seq数据分析,更容易读懂文献中的相关技术和分析方法,帮助自己设计RNA-seq实验甚至自己尝试分析。欢迎大家踊跃参加和提问。

张超简介:

本科电子科技大学生物技术专业,参加学校与华大基因联合培养,曾在华大个人基因组部门从事疾病基因组学的研究工作。此后在北京诺禾致源生物信息公司开发X-Ten平台全基因组重测序的变异检测分析流程。

2015年1月加入北大生科院生物信息学平台,开始建立RNA-seq分析方法和流程。

欢迎各位老师同学积极参加